预后生物标记物就是一种可以预示患者生存（与所接受的治疗无关）的生物分子；预测生物标记物是预示疗效的生物分子；目前最为有力标记物的证据有：表皮生长因子受体（EGFR）、核苷酸剪切修复复合体（ERCC1）的5'核酸内切酶、原癌基因Kirsten-Rous肉瘤病毒（K-ras）、核糖核苷酸还原酶的调节亚基（RRM1）。
 
EGFR突变、基因拷贝数和EGFR表达水平
       EGFR是一种跨膜受体，EGF结合于胞外结构域即形成受体二聚体并激活胞内酪氨酸激酶结构域，引发激酶自磷酸化和下游分子的磷酸化，激活包括增殖和存活在内的多种细胞功能。近80%~85%的NSCLC患者可检测到EGFR，其表达水平在一个连续的范围中差异很大。最常见的EGFR突变为外显子19缺失（E19del）和外显子21 L858R突变，二者都会导致酪氨酸激酶结构域活化，且都与肿瘤对小分子TKIs（厄洛替尼、吉非替尼）的敏感度相关。这些突变见于近10%~15%的白种人NSCLC患者及30%~40%的亚洲患者。EGFR突变E19del和L858R的预后作用尚不明确，预测作用已明确。携带这些突变基因的患者对厄洛替尼或吉非替尼的反应明显较佳。一项近期的回顾性研究显示，携带EGFR突变（E19del占53%，L858R占26%，其他突变占21%）的非鳞状细胞癌北美患者，其客观缓解率达55%，中位无进展生存期为9.2个月。在接受一线化疗联合或不联合厄洛替尼的患者中，接受厄洛替尼组EGFR突变预示缓解率更高（突变者53% vs 无突变者18%）。在仅接受化疗组，突变者的缓解率为21%，无突变者为27%。
 
 ECRR1表达水平
       ECRR1是核苷酸剪切修复复合体的5'核酸内切酶。ECRR1见于所有的肿瘤细胞，其表达水平差异很大。在完全切除的、未接受过围手术期化疗或放疗的NSCLC患者中，ERCC1 mRNA水平是生存预后指标。肿瘤ERCC1 mRNA高表达的患者生存期显著长于低表达者。肿瘤ERCC1高表达的患者中位总生存期为55个月，而低表达者为42个月。多项转化型研究证明，ERCC1水平可用于预测含铂化疗治疗NSCLC的疗效；高水平者耐药，低水平者敏感。IALT试验中已行手术切除的大组NSCLC患者群中，采用标准免疫组化法测定的ERCC1蛋白表达可以预测含顺铂辅助治疗的获益情况，只有肿瘤ERCC1蛋白低表达者可从辅助化疗中获益（校正的死亡风险比，0.65；95% CI，0.50~0.86；P =0.002）。Bepler等一项III期随机临床研究的肿瘤标本中，其原位ERCC1蛋白表达水平与卡